南京医药股份有限公司健康连锁业务近年来以健康利益管理为主线，以消费者管理为核心，调整零售终端模式，积极打造标准化、专业化、模式化的门店经营模式，强化药学服务与人文关怀，推动药店经营从“以药品为中心”的保障供应型向“以患者为中心”的技术服务型的全面转型，逐步形成基于社区健康管理的标准化药房（含方便诊所）、专业化药房（积极承接大型医疗机构门诊药房和社区卫生服务中心的药事服务职能）、中医中药模式店、智慧健康园。现有各类型门店324家、院内药房6家、诊所11家。主要覆盖江苏、安徽、福建三省，连续3年健康连锁业务销售规模位于中国药品流通行业零售连锁企业前20位。
       南京医药健康连锁业务以药学服务为核心，打造两支队伍，两支队伍即一支具有专业药学知识的员工队伍、一支稳定可靠的慢病患者队伍。通过结合国外先进慢病管理运作经验，重点开展慢病患者的管理与维护，提供集“慢病检测+远程监测+用药指导+健康档案管理”为一体的慢病管理服务，形成以消费者健康需求服务和健康利益管理为核心的“南京医药健康管理”品牌，推动零售药店向健康服务型转变。2016年，南京医药正式启动了“慢病管理中心”项目，为零售终端药学服务专业人员提供更加专业和系统的培训，为慢病患者提供标准化的用药指导和保健服务，提高处方药在零售渠道的深度渗透。目前已在百信药房、徐州广济、合肥大药房先后开辟近43家药学服务专区，由专业药学服务人员依据社区居民的健康服务需求和“互联网+”平台，开展会员的开发与维护、基本体征数据检测及健康档案建立、用药指导与消费分析、慢病干预与生活指导等，初步形成具有南京医药特色的健康管理服务模式。截止目前，会员销售占比提升，客单价提升。
　　公司在江苏省内企业共有执业药师144人、医药及相关专业中高级职称22人。